Я в установленный срок не выделила доли детям, в какой орган мне обратиться, чтобы выделить им доли сейчас?

Здравствуйте.

Видимо, речь о наделении детей долями в жилом помещении, купленном с использованием материнского капитала.

Достаточно составить договор и передать его на регистрацию в МФЦ. Организационно проще всего будет обратиться к нотариусу. Вам и договор подготовят и смогут передать его на регистрацию в электронном виде.