Здравствуйте.2 года назад в муниципальной квартире были прописаны дети .Имеют ли они сейчас право на долю .Прописаны в доме.

Регистрация по месту жительства не означает права собственности на помещение.

Кроме того, если квартира муниципальная, значит она в собственности муниципалитета, а не в собственности проживающих в ней граждан. 

Граждане, живущие в квартире, вероятнее всего пользуются квартирой на основании договора социального найма.

Если дети являются членами семьи нанимателя, то они могут  с ним проживать.