Как в данном случае нам правильно оформить договор?

Договор на 1 000 000 руб(без НДС) у АО "Генподрядчик" платильщик НДС и ООО "Подрядчик" не платильщик НДС
У ООО "Подрядчик" не платильщик НДС и АО "Субподрядчик" платильщик НДС
договор тоже на 1млн.руб, но только уже с НДС получается?
или можно делать договор на 1млн. руб. с НДС с ООО "Подрядчик" и АО "Субподрядчик"????