Здравствуйте, Андрей!
Обследование сейчас Вам проходить, как я считаю, обязательно, хотя бы потому что Вы «потерялись» на 1,5-2 года, за которые состояние здоровья могло улучшиться либо ухудшилось (Вы этого можете даже не чувствовать), а актуальная на момент призыва характеристика Вашего здоровья важна для определения годности к службе.
Я бы не советовал Вам отказываться от направлений на дополнительных обследований военно-врачебной комиссии военкомата.
Во-первых, дополнительные обследования (в том числе фгдс) предназначено для установления правильного диагноза, чтобы правильно определить категории Вашей годности к военной службе. А то, может получится история, когда Вы на самом деле негодны к службе, а врачи военкомата в отсутствии результатов дополнительного обследования неверно определять степень Вашей годности и призовут на службу.
Во-вторых, иногда случается так, что при отказе пройти дополнительное обследование военный комиссариат может составить в отношении Вас протокол об административном правонарушении по статье 21.5 КоАП РФ за уклонение от призыва и привлечь вас к ответственности. Штраф по этой статье минимальный, но на второй раз военком может направить материалы в Следственный комитет для возбуждения уголовного дела по факту уклонения от военной службы.
Поэтому, если у вас имеются проблемы со здоровьем (даже если Вы чувствуете себя нормально), лучше пройдите обследование. Хотя бы потому что, когда попадёте в армию, лечиться и жаловаться будет уже поздно.
Ничего проходить дополнительно Вам можно было бы, если бы Ваш диагноз был недавно подтверждён лечащим врачом или другим врачом-специалистом, к которому обращались или лечитесь. Тогда направление военкомата можно было бы считать не дополнительным, а повторным.
Однако, примерный образец заявления прилагаю.