Здравствуйте, Андрей!
Проще всего обратиться в прокуратуру с жалобой. Если после проверки будет установлено, что зарплату не выплачивают частично свыше трех месяцев или полностью свыше двух, то работодатель может быть привлечен к уголовной отсветственности по ст. 145.1 УК РФ.
В ходе расследования вы будете признаны гражданским истцом и, если дела дойдёт до суда (в случае если зарплату не выплатят) то суд, одновременно с уголовным делом, рассмотрит и ваш гражданский иск. Но, как правило, руководители, стараются не доводить дело до прокурора.
Если же задолженность не так длительна, или же вы жалеете работодателя, то вы можете обратиться в порядке альтернативной подсудности в районный суд, как по месту своего жительства, так и по месту нахождения ответчика, см. ч. 6.3 ст. 29 ГПК
Иски о восстановлении трудовых прав могут предъявляться также в суд по месту жительства истца.
Если зарплата начислена, но не выплачена, то быстрее всего - заявление о выдаче судебного приказа в мировой суд по месту нахождения должника,