Протоколы составляются сначала об отстранении, акт освидетельствования на состояние алкогольного опьянения (если без врача), о задержании транспортного средства (при необходимости), протокол об административном правонарушении.
Обратит или не обратит внимание на нарушение последовательности зависит только от Вас и Вашего защитника (если он есть). Все зависит от того, как Вы представите судье эти обстоятельства. Здесь довольно много юридических тонкостей, которые даже невсе юристы применяют.
Сам факт нарушения последовательности составления протоколов ни о чем не говорит. Важно, к каким последствиям это нарушение привело, как нарушены оказались Ваши права на судебную защиту и т.п.
Ват это и надо будет преподнести судье убедительно и аргументированно.