Здравствуйте, Serg. В вашем случае, при отсутствии добровольного согласия матери ребенка прописать его по другому адресу, снять с регистрационного учета несовершеннолетнего не получиться.
Согласно разъяснениям, содержащимся в п. 14 Постановления Пленума Верховного Суда Российской Федерации N 14 от 02.07.2009 «О некоторых вопросах возникших при применении Жилищного кодекса Российской Федерации», в силу положений Семейного кодекса Российской Федерации об ответственности родителей за воспитание и развитие своих детей, их обязанности заботиться об их здоровье, физическом, психическом, духовном и нравственном, развитии расторжение брака родителей, признание его недействительным или раздельное проживание родителей не влияют на права ребенка (п.1 ст.55, п.1 ст.63 Семейного кодекса Российской Федерации), в том числе на жилищные права. Поэтому прекращение семейных отношений между родителями несовершеннолетнего ребенка, проживающего в жилом помещении, находящемся в собственности одного из родителей, не влечет за собой утрату ребенком права пользования жилым помещением в контексте правил ч.4 ст.31 Жилищного кодекса Российской Федерации.
Это значит, что ребенок имеет право до достижения совершеннолетия, быть зарегистрированным по указанному адресу.
Ознакомьтесь с решением суда по аналогичному делу: https://sudact.ru/regular/doc/8Z6Fg7YUhTox/