Я живу в Самаре, не на севере. По долгу службы в командировке нахожусь часто. Например, два месяца работаю на севере, а 25 дней дома. Могут ли мне начисляться "полярки", чтобы если я перешёл бы в северную компанию на работу, то мне бы они защитались.

Добрый день.

Командировка в районы Крайнего Севера оплачивается по общему правилу. Районный коэффициент и северная надбавка начислению не подлежат.

Согласно ст. 167 ТК РФ

При направлении работника в служебную командировку ему гарантируются сохранение места работы (должности) и среднего заработка, а также возмещение расходов, связанных со служебной командировкой.

В соответствии со ст. 168 ТК РФ в случае направления в служебную командировку работодатель обязан возмещать работнику:
расходы по проезду;
расходы по найму жилого помещения;
дополнительные расходы, связанные с проживанием вне места постоянного жительства (суточные);
иные расходы, произведенные работником с разрешения или ведома работодателя.

Увеличение размера заработной платы в период командировки законом не предусмотрено — соответственно нет оснований для выплаты заработной платы с применением районного коэффициента. 

На это указано и в «Докладе с руководством по соблюдению обязательных требований, дающих разъяснение, какое поведение является правомерным, а также разъяснение новых требований нормативных правовых актов за I квартал 2018 года»(утв. Рострудом)

которым прямо указано, на невозможность выплаты заработной платы с применением «северных» коэффициентов лицам, находящимся в командировке на Крайнем Севере или в приравненных к ним районах.