Есть компания.

Пополнение возможно только безналичным способом через сайт или мобильное приложение.

Можно ли брать с клиентов наличные, сразу же зачисляя их им на баланс?

Например:

Пришел клиент, дал 200 рублей наличными.

Мы берем 200 рублей и с кредитной карты зачисляем деньги клиенту на счет.

Получается честный обмен.

Каковы риски таких платежей в виде налогов? считается ли это незаконным способом?

Кассу устанавливать не потянем. Компания ООО.