Гражданка РБ получила гражданство РФ. Фактически имеет два паспорта. Живёт и работает в РФ. Покупает билеты и оформляет визы по паспорту РФ.

Периодически выезжает в Польшу на поезде.

Соответственно паспортный контроль проходит белорусский.

До этого выезжала и въезжала по паспорту РФ.

Сейчас в Бресте поезд стоит 3:23 и за это время можно пробить по всем базам.

Как правильно выезжать и въезжать?

Если выехать по беларусскому, с ней ребёнок у которого российское свидетельство о рождении и в нем она (мама ребенка) указана как гражданка РФ.