Открыли Ип в 2009 году, не разу не работали через него, накапали большие долги. Никакие отчётности не сдавали. Могут ли за это посадить в тюрьму?

Посадить не посадят, а долги платить придется, индивидуальный предприниматель, как физическое лицо, по долга отвечает всем своим личным имуществом и деньгами на счетах.